Home Site Map Site Stats Contact Us

Icon 05 TreeGenes

Sequence Resources

Summary by Genus

Colleague Directory

Colleagues Organizations

Species Database

Forest Trees

Literature Database

Search Literature

Transcriptome Database

Search Transcriptome Transcriptome Summary

Protein Database

Search Proteins Protein Summary

Expression Studies

Search Expression Expr. Studies Summary

Association PopGen

View TGDR

DiversiTree

Genotype, Phenotype & Sequence CartograTree

Comparative Mapping Database

Published Maps Maps Recently Submitted Search Cmap

Genome Transcriptome Browser

Browser Portal

Submissions

Submit to TreeGenes

Icon 02 Links

Conifer Genome Network PineRefSeq Project SMarTForests Project Conifer Translational Genomics Network TreeGenes Database Dendrome Plone Forestry Careers and Education Resource

TreeGenes Data Repository

A listing of data submissions is displayed below.
To submit data to TreeGenes, click here.

Date Accession Paper Title Species Data Statistics Data Files
8/5/2011 TGDR001 Association genetics of traits controlling lignin and cellulose biosynthesis in black cottonwood (Populus trichocarpa, Salicaceae) secondary xylem. Populus trichocarpa Total Sites: 1
Total Samples: 480
Total Genotypes: 419520
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 874
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 1344
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Covariate Data (Population Structure)
Genotype Data (SNP)
GPS Data
Haplotype Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
9/25/2012 TGDR002 Astonishingly low genetic variation in Quercus acutissima, an important tree species in Satoyama, a traditional Japanese rural forest and agricultural landscape, revealed by chloroplast microsatellite markers Quercus acutissima Total Sites: 59
Total Samples: 2152
Total Genotypes: 12912
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 6
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (cpSSR)
GPS Data
Haplotype Data
Supplemental Data
11/5/2012 TGDR003 Extensive selfing in an endangered population of Pinus parviflora var. parviflora (Pinaceae) in the Boso Hills, Japan Pinus parviflora Total Sites: 2
Total Samples: 116
Total Genotypes: 464
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 4
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Supplemental Data
Supplemental Data
Supplemental Data
Supplemental Data
11/14/2012 TGDR004 Pollen dispersal and fine-scale spatial genetic structure of Dryobalanops lanceolata in a Bornean rain forest Dryobalanops lanceolata Total Sites: 1
Total Samples: 858
Total Genotypes: 13728
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 16
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 5148
Total Environmentals (per site): 0
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
Genotype Data (SSR)
3/19/2013 TGDR005 Jatropha curcas L. (Euphorbiaceae) exhibits a mixed mating system, high correlated mating and apomixis Jatropha curcas Total Sites: 1
Total Samples: 330
Total Genotypes: 3300
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 10
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Supplemental Data
3/19/2013 TGDR006 Genetic structure and association mapping of adaptive and selective traits in the East Texas loblolly pine (Pinus taeda L.) breeding populations Pinus taeda Total Sites: 22
Total Samples: 1705
Total Genotypes: 7270120
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 4264
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 22165
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SNP)
Phenotype Data
Phenotype Definitions
Supplemental Data
Supplemental Data
6/28/2013 TGDR007 Environmental, historic and population genetic factors affecting persistence of butternut in nineteen watersheds of the southern Appalachian Mountains, U.S.A. Juglans cinerea Total Sites: 19
Total Samples: 161
Total Genotypes: 4830
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 30
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
7/10/2013 TGDR008 Molecular analysis of natural root grafting in jack pine (Pinus banksiana) trees: how genetic proximity influenced anastomosis presence? Pinus banksiana Total Sites: 7
Total Samples: 105
Total Genotypes: 1680
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 16
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
8/5/2013 TGDR009 Genetic analysis of Pongamia pinnata (L.) Pierre populations using AFLP markers Millettia pinnata Total Sites: 5
Total Samples: 33
Total Genotypes: 17556
Total AFLP Markers: 532
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 33
Total Environmentals (per sample): 99
Total Environmentals (per site): 0
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
Genotype Data (AFLP)
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
8/9/2013 TGDR010 Genetic variation of teak (Tectona grandis Linn. f.) in Myanmar revealed by microsatellites Tectona grandis Total Sites: 18
Total Samples: 1667
Total Genotypes: 33340
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 20
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
8/16/2013 TGDR011 Genetic diversity and differentiation of Juniperus thurifera in Spain and Morocco as determined by SSR Juniperus thurifera Total Sites: 11
Total Samples: 261
Total Genotypes: 6264
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 24
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
8/26/2013 TGDR012 Fine-scale genetic structure of the threatened rosewood Dalbergia nigra from the Atlantic Forest: comparing saplings versus adults and small fragment versus continuous forest Dalbergia nigra Total Sites: 1
Total Samples: 218
Total Genotypes: 3052
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 14
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
9/9/2013 TGDR013 Provenance tests for survival and growth of 50-year-old Japanese larch (Larix kaempferi) trees related to climatic conditions in central Japan Larix kaempferi Total Sites: 28
Total Samples: 260
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 2860
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 504
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
9/11/2013 TGDR014

Post-pollination paternal reproductive success in Populus nigra: a male affair

Populus nigra Total Sites: 1
Total Samples: 926
Total Genotypes: 16668
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 18
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
9/15/2013 TGDR015 Fengshui forests conserve genetic diversity: a case study of Phoebe bournei (Hemsl.)Yang in southern China Phoebe bournei Total Sites: 6
Total Samples: 65
Total Genotypes: 6760
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 104
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
9/26/2013 TGDR016 Range-wide phylogeography in Pinus mugo-uncinata complex: contrasting pattern of genetic structure between mountain and peat-bog pines Pinus mugo Total Sites: 44
Total Samples: 1331
Total Genotypes: 13310
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 10
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (cpSSR)
GPS Data
Supplemental Data
11/1/2013 TGDR017 Landscape genetics of Persian walnut (Juglans regia L.) across its Asian range Juglans regia Total Sites: 39
Total Samples: 926
Total Genotypes: 25928
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 28
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
11/13/2013 TGDR018 AFLP markers for analysis of genetic diversity, gene flow and structure of Indian teak (Tectona grandis L.f.) populations Tectona grandis Total Sites: 10
Total Samples: 96
Total Genotypes: 27456
Total AFLP Markers: 286
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (AFLP)
GPS Data
11/14/2013 TGDR019 Linking environmental instability to genetic diversity in mountain forests of Polylepis australis, an Andean tree species Polylepis australis Total Sites: 18
Total Samples: 208
Total Genotypes: 50752
Total AFLP Markers: 244
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 54
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
Genotype Data (AFLP)
GPS Data
11/22/2013 TGDR020 MOLECULAR marker ASSOCIATED with a recessive anomaly in Eucalyptus grandis Hill ex Maiden Eucalyptus grandis Total Sites: 1
Total Samples: 252
Total Genotypes: 252
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 1
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 1512
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (RAPD)
Phenotype Data
Phenotype Definitions
Supplemental Data
2/20/2014 TGDR021 Population genetic analysis of Xylia xylocarpa (Fabaceae - Mimosoideae) in Thailand Xylia xylocarpa Total Sites: 17
Total Samples: 548
Total Genotypes: 8768
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 16
Total Phenotypes: 548
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
3/6/2014 TGDR022 Genotypic variation in growth and wood quality traits of Corymbia citriodora subsp. variegata across three progeny trials in Queensland, Australia Corymbia citriodora subsp. variegata Total Sites: 3
Total Samples: 10142
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 101420
Total Environmentals (per sample): 10142
Total Environmentals (per site): 0
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
Phenotype Data
Phenotype Definitions
3/12/2014 TGDR023 Phenotypic and genotypic correlations for wood properties of hybrid poplar clones of Southern Quebec Populus sp. UG-2006 Total Sites: 3
Total Samples: 105
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 1365
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Phenotype Data
Phenotype Definitions
3/31/2014 TGDR024 Shared phylogeographic patterns and widespread chloroplast haplotype sharing in Eucalyptus species with different ecological tolerances Eucalyptus delegatensis Total Sites: 12
Total Samples: 120
Total Genotypes: 600
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 5
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (cpSSR)
GPS Data
4/2/2014 TGDR026 Shared phylogeographic patterns and widespread chloroplast haplotype sharing in Eucalyptus species with different ecological tolerances Eucalyptus obliqua Total Sites: 27
Total Samples: 265
Total Genotypes: 1325
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 5
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
4/2/2014 TGDR027 Shared phylogeographic patterns and widespread chloroplast haplotype sharing in Eucalyptus species with different ecological tolerances Eucalyptus regnans Total Sites: 27
Total Samples: 270
Total Genotypes: 1350
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 5
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (cpSSR)
GPS Data
5/7/2014 TGDR028 Maintaining high levels of genetic diversity and low levels of inbreeding through intensive pollen flow of the coniferous Araucaria angustifolia: a landscape level study in Southern Brazil Araucaria angustifolia Total Sites: 1
Total Samples: 295
Total Genotypes: 5900
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 20
Total Phenotypes: 590
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
Supplemental Data
Supplemental Data
Supplemental Data
Supplemental Data
Supplemental Data
5/25/2014 TGDR029 The genetic diversity and introgression of Juglans regia and J. sigillata in Tibet as revealed by SSR markers Juglans sigillata Total Sites: 4
Total Samples: 109
Total Genotypes: 2616
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 24
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
5/25/2014 TGDR030 The genetic diversity and introgression of Juglans regia and J. sigillata in Tibet as revealed by SSR markers Juglans regia Total Sites: 5
Total Samples: 100
Total Genotypes: 2400
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 24
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
5/28/2014 TGDR031 Genetic parameters and clone by environment interactions for growth and foliar nutrient concentrations in radiata pine on 14 widely diverse New Zealand sites Pinus radiata Total Sites: 14
Total Samples: 21503
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 623587
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 56
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
Phenotype Data
Phenotype Definitions
6/2/2014 TGDR032 Genetic structure and demographic history of the northward-expanding marginal populations of Fagus crenata Fagus crenata Total Sites: 33
Total Samples: 1693
Total Genotypes: 40632
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 24
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
6/3/2014 TGDR033 Association mapping for wood quality and growth traits in Eucalyptus globulus ssp. globulus Labill identifies nine stable marker-trait associations for seven traits Eucalyptus globulus subsp. globulus Total Sites: 2
Total Samples: 681
Total Genotypes: 66738
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 98
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SNP)
Supplemental Data
Supplemental Data
Supplemental Data
7/4/2014 TGDR034 Genetic characterization of chestnut (Castanea sativa Mill.) orchards and traditional nut varieties in El Bierzo, a glacial refuge and major cultivation site in Northwestern Spain Castanea sativa mill Total Sites: 11
Total Samples: 50
Total Genotypes: 1100
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 22
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Supplemental Data
8/5/2014 TGDR035 Nuclear genetic variation across the range of ponderosa pine (Pinus ponderosa): Phylogeographic, taxonomic and conservation implications Pinus ponderosa Total Sites: 105
Total Samples: 3123
Total Genotypes: 43722
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 14
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Supplemental Data
Supplemental Data
9/8/2014 TGDR036 A reciprocal transplant trial reveals asymmetric local adaptation in survival and growth of Japanese red pine (Pinus densiflora) trees Pinus densiflora Total Sites: 2
Total Samples: 215
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 2580
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
9/10/2014 TGDR037 Genetic structure in Pinus cembra from the Carpathian Mountains inferred from nuclear and chloroplast microsatellites confirms post-glacial range contraction and identifies introduced individuals Pinus cembra Total Sites: 31
Total Samples: 622
Total Genotypes: 14316
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 4
Total SSR Markers: 22
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (cpSSR)
Genotype Data (SSR)
GPS Data
GPS Data
9/12/2014 TGDR038 Genetic structure in Pinus cembra from the Carpathian Mountains inferred from nuclear and chloroplast microsatellites confirms post-glacial range contraction and identifies introduced individuals Pinus sibirica Total Sites: 4
Total Samples: 63
Total Genotypes: 1386
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 22
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Supplemental Data
11/4/2014 TGDR039 Genetic diversity and inbreeding in natural and managed populations of Scots pine Pinus sylvestris Total Sites: 9
Total Samples: 1753
Total Genotypes: 48912
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 10
Total SSR Markers: 18
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (cpSSR)
Genotype Data (SSR)
Genotype Data (SSR)
11/14/2014 TGDR040 A candidate gene-based association study reveals significantly associated SNPs with bud burst in European beech (Fagus sylvatica L.) Fagus sylvatica Total Sites: 6
Total Samples: 1405
Total Genotypes: 64630
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 46
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 4215
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SNP)
Phenotype Data
Phenotype Definitions
11/24/2014 TGDR041 Using genetic diversity and mating system parameters estimated from genetic markers to determine strategies for the conservation of Araucaria angustifolia (Bert.) O. Kuntze (Araucariaceae) Araucaria angustifolia Total Sites: 4
Total Samples: 1141
Total Genotypes: 22820
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 20
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
12/19/2014 TGDR042 Protected areas of Spain preserve the genetic diversity of Quercus ilex L. irrespective of glacial refugia Quercus ilex Total Sites: 68
Total Samples: 666
Total Genotypes: 137860
Total AFLP Markers: 215
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 3
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (AFLP)
Genotype Data (SNP)
GPS Data
GPS Data
Supplemental Data
Supplemental Data
1/20/2015 TGDR043 Phylogeography of Syringa josikaea (Oleaceae): Early Pleistocene divergence from East Asian relatives and survival in small populations in the Carpathians Syringa josikaea Total Sites: 25
Total Samples: 135
Total Genotypes: 1080
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 8
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
2/9/2015 TGDR044 Parentage reconstruction in Eucalyptus nitens using SNPs and microsatellites: a comparative analysis of marker data power and robustness. Eucalyptus nitens Total Sites: 2
Total Samples: 77
Total Genotypes: 4466
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 58
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
3/5/2015 TGDR045 Genetic structure and internal gene flow in populations of Schinus molle (Anacardiaceae) in the Brazilian Pampa Schinus molle Total Sites: 9
Total Samples: 278
Total Genotypes: 69500
Total AFLP Markers: 250
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (AFLP)
GPS Data
4/20/2015 TGDR046 Estimating heritability of disease resistance and factors that contribute to long-term survival in butternut (Juglans cinerea L.) Juglans cinerea Total Sites: 3
Total Samples: 464
Total Genotypes: 20416
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 44
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
6/4/2015 TGDR048 Gene flow and genetic structure of a mountain riparian tree species, Euptelea pleiospermum (Eupteleaceae): how important is the stream dendritic network? Euptelea pleiospermum Total Sites: 12
Total Samples: 240
Total Genotypes: 3840
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 16
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
6/23/2015 TGDR050 Dissecting the growth performance of Populus trichocarpa provenances from the US Pacific Northwest. Analysis of genetic variation in growth, ecophysiology, and chemical and metabolomic composition of wood Populus trichocarpa Total Sites: 461
Total Samples: 461
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 80675
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
7/27/2015 TGDR051 Phenotype variation and homozygous tendency generated by self-pollination of Juglans sigillata Dode Juglans sigillata Total Sites: 1
Total Samples: 10
Total Genotypes: 920
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 92
Total Phenotypes: 210
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
Phenotype Data
Phenotype Definitions
Supplemental Data
9/25/2015 TGDR052 Assessing the genetic diversity and population structure of black alder (Alnus glutinosa [L.] Gaertn) using nuclear SSR and CpDNA markers Alnus glutinosa Total Sites: 85
Total Samples: 305
Total Genotypes: 8540
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 28
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
10/5/2015 TGDR053 Winter and Autumn frost hardiness in Juglans regia L. Juglans regia Total Sites: 19
Total Samples: 306
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 1836
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
10/7/2015 TGDR054 Heritability and Repeatability Estimates for Tree Height from Diallel Progeny Test Data of Coast Redwood (Sequoia sempervirens (D. Don) Endl.) Sequoia sempervirens Total Sites: 3
Total Samples: 1755
Total Genotypes: 0
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 5265
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
10/14/2015 TGDR055 Using parentage analysis to assess apomixis, seed and pollen dispersal distance and patterns in the Neotropical tree Aspidosperma polyneuron Aspidosperma polyneuron Total Sites: 2
Total Samples: 844
Total Genotypes: 14348
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 17
Total Phenotypes: 1688
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
10/30/2015 TGDR056 Population genetic diversity of the rare hardwood butternut (Juglans cinerea) in the Northeastern United States Juglans cinerea Total Sites: 16
Total Samples: 206
Total Genotypes: 2472
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 12
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
2/12/2016 TGDR057 Effects of different silvicultural systems on the genetic diversity of Shorea parvifolia populations in the tropical rainforest of Southeast Asia Shorea parvifolia Total Sites: 23
Total Samples: 426
Total Genotypes: 14484
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 34
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
GPS Data
4/25/2016 TGDR058 QTL mapping for resistance to Ceratocystis wilt in Eucalyptus [Eucalyptus dunnii (D) x Eucalyptus grandis (G)] x [Eucalyptus urophylla (U) x Eucalyptus globulus (GL)] Total Sites: 1
Total Samples: 129
Total Genotypes: 14190
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 110
Total Phenotypes: 129
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SSR)
Phenotype Data
Phenotype Definitions
4/25/2016 TGDR059 Patterns of neutral and adaptive genetic diversity across the natural range of sugar pine (Pinus lambertiana Dougl.) Pinus lambertiana Total Sites: 13
Total Samples: 313
Total Genotypes: 58218
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 186
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 7199
Total Environmentals (per site): 0
Environmental Metric Data
Environmental Metric Definitions
Genotype Data (SNP)
GPS Data
5/23/2016 TGDR060 Association of single nucleotide polymorphisms with form traits in three New Zealand populations of radiata pine in the presence of genotype by environment interactions Pinus radiata Total Sites: 4
Total Samples: 1599
Total Genotypes: 81549
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 51
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SNP)
6/16/2016 TGDR061 Dissection of insertion-deletion (InDel) variations within complex gene networks underlying wood formation in Populus Populus tomentosa Total Sites: 1
Total Samples: 435
Total Genotypes: 832590
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 0
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SNP)
Supplemental Data
Supplemental Data
7/26/2016 TGDR062 Identification of associations between SNPs and bud burst timing in European beech (Fagus sylvatica L.) Fagus sylvatica Total Sites: 6
Total Samples: 600
Total Genotypes: 27600
Total AFLP Markers: 0
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 46
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 1800
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 0
Genotype Data (SNP)
GPS Data
Phenotype Data
Phenotype Definitions
Supplemental Data
3/9/2017 TGDR069 Variation of cytosine methylation patterns in European beech (Fagus sylvatica L.) Fagus sylvatica subsp. sylvatica Total Sites: 20
Total Samples: 435
Total Genotypes: 23490
Total AFLP Markers: 54
Total RAPD Markers: 0
Total SNP Markers: 0
Total cpSSR Markers: 0
Total SSR Markers: 0
Total Phenotypes: 2175
Total Environmentals (per sample): 0
Total Environmentals (per site): 140
Data scheduled for release on 2017-06-09.